Unused levels for evolution:

List:

1. 2
2. 3
3. 4
4. 5
5. 6
6. 8
7. 11
8. 13
9. 46
10. 51
11. 56
12. 57
13. 58
14. 61
15. 62
16. 63

Three stagers, first stage to second:

1. 1
2. 2
3. 3
4. 4
5. 5
6. 6
7. 8
8. 11
9. 12
10. 13
11. 23
12. 26
13. 27
14. 31
15. 34
16. 36
17. 37
18. 44
19. 45
20. 46
21. 47
22. 48
23. 49
24. 51
25. 52
26. 53
27. 54
28. 55
29. 56
30. 57
31. 58
32. 59
33. 60
34. 61
35. 62
36. 63
37. 64

Dual stagers:

1. 2
2. 3
3. 4
4. 5
5. 6
6. 7
7. 8
8. 9
9. 11
10. 12
11. 13
12. 14
13. 16
14. 17
15. 19
16. 29
17. 41
18. 43
19. 44
20. 45
21. 46
22. 47
23. 49
24. 51
25. 53
26. 55
27. 56
28. 57
29. 58
30. 60
31. 61
32. 62
33. 63
34. 64

Three stagers, second stage to third:

1. 2
2. 3
3. 4
4. 5
5. 6
6. 7
7. 8
8. 9
9. 11
10. 13
11. 14
12. 15
13. 16
14. 17
15. 19
16. 20
17. 21
18. 22
19. 23
20. 24
21. 25
22. 26
23. 29
24. 31
25. 33
26. 37
27. 38
28. 39
29. 43
30. 46
31. 51
32. 52
33. 54
34. 56
35. 57
36. 58
37. 59
38. 61
39. 62
40. 63

Edit (29.12.2019): Removed Dragapult's Level 60 evolution.